La historia se emplaza en el periodo Sengoku. Un ronin llamado Nanashi (sin nombre) salva a un niño llamado Kotarou en un templo abandonado. Kotarou no tiene familia, está siendo perseguido por una organización misteriosa de China y contrata a Nanashi como guardaespaldas. Entre los hombres que persiguen a Kotarou es un hombre llamado Rarou, un guerrero experimentado de pelo rubio y ojos azules. Obedece a un viejo llamado Byakuran y es miembro de la milicia china. Al contrario de sus compañeros, no sigue a ningún emperador y sólo quiere luchar con los más fuertes.
La historia esta ambientada en Japón, a principios de verano de 2015. Alrededor de 180.000 personas viven en Tachikawa City, la segunda metrópolis de la zona de Tokyo. Entre esas personas están los Gatchaman, guerreros que luchan en trajes especialmente reforzados impulsados por NOTE, la manifestación de poderes espirituales especiales en los seres vivos. Un consejo reclutó un grupo de individuos con latentes poderes para proteger la Tierra de criminales extraterrestres, y durante los años más recientes, el consejo ha asignado a los guerreros Gatchaman el lidiar con la misteriosa entidad conocida como MESS.
Después de que ocurrieran varias cosas, ¡obtuve una habilidad de Dios y me reencarné en otro mundo! Mientras era vigilado por mi familia de alto nivel, el súper ordinario yo disfrutaba plenamente de la vida del otro mundo. Usando la habilidad que recibí de Dios, tuve una vida diaria de sólo mullir y acariciar animales de fantasía. También hay algunos movimientos turbios, pero mientras sea guiado por la nariz por Dios, ¡haré lo mejor que pueda en varias cosas con mis camaradas tramposos!
Los Perdidos son vagabundos que llegan aquí desde un mundo lejano conocido como "Japón". Nadie sabe cómo ni por qué abandonan sus hogares. Lo único cierto es que traen el desastre y la calamidad. El deber de exterminarlos sin remordimientos recae en Menou, una joven Verdugo. Cuando conoce a Akari, parece un trabajo más... ¡hasta que descubre que es imposible matar a esta chica! Y cuando Menou comienza a buscar una forma de derrotar a esta inmortalidad, ¡Akari está más que feliz de acompañarla! Así comienza un viaje que cambiará a Menou para siempre...
Gift es un mundo cubierto de cristales brillantes azules llamados gifdium. Sougo Amagi es un chico que vive en la ciudad de Jardín Indigo, que ha prosperado con la extracción de estos cristales. Sougo tiene como hobby coleccionar cristales raros, un día se ve envuelto en una disputa entre compañeros de clase Kaon, Roman y Otto. Al demabular en las ruinas de una mina y descubre un lago subterráneo. Allí, Sougo conoce a una misteriosa chica con el pelo azul y los ojos rojos.
Los agentes de la corporación ARCAM cuidan que los poderosos artefactos de una antigua civilización alienígena no caigan en manos equivocadas.
En la ciudad de Ert’Aria nos encontramos con Leicester Maycraft, un ingeniero que forma parte del grupo de aventureros «Oasis». Durante un festival que se da por la noche para observar la lluvia de estrellas, un meteoro cae sobre el campanario y destruye el campanario. Encuentran un habitación secreta en la que hay una chica dormida. Ella despierta y le dice que es su hija.